Multisite atascado en 1MB para el tamaño máximo de archivo

Tengo una instalación de Wordpress Multisite en nuestro servidor de desarrollo FreeBSD. Parece estar atascado en 1MB.

Tengo las siguientes configuraciones en php.ini

upload_max_filesize = 100M  
post_max_size = 100M  
max_execution_time = 300  

Todas las instalaciones regulares de WordPress en el sitio tienen un tamaño máximo de subida de 100MB, como se espera. Sin importar los valores que ponga, la instalación multisite se queda atascada en 1MB.

La configuración:

• FreeBSD 8.1
• PHP 5.3.3
• Wordpress Multisite 3.2.1

Después de mover el sitio a otro servidor en Rackspace, tiene los mismos problemas.

Cualquier ayuda para aumentar este límite sería apreciada. Si dejé fuera alguna información pertinente, házmelo saber y proporcionaré lo que pueda.