Obtener todos los usuarios con una clave meta específica

Puedes usar solo el argumento meta_key, el resultado será similar a usar la sentencia SQL EXISTS.

<?php
$users = get_users(array(
    'meta_key'     => 'tu_meta_key',
));

Alternativamente, puedes usar una cadena vacía para meta_value (el valor por defecto) y > para meta_compare. El resultado es el mismo (probablemente porque meta_value se ignora si está vacío).

<?php
$users = get_users(array(
    'meta_key'     => 'tu_meta_key',
    'meta_value'   => '',
    'meta_compare' => '>',
));

El primer método también funciona cuando se usa WP_Query y meta_query. Ejemplo de uno de mis plugins:

    $links = get_posts(array(
        'post_type'   => self::POST_TYPE,
        'numberposts' => apply_filters('seoal_number_links', -1),
        'meta_query'  => array(
            'relation' => 'AND',
            array(
                'key'     => self::get_key("type_{$post->post_type}"),
                'value'   => 'on',
                'compare' => '='
            ),
            array(
                'key'     => self::get_key('url'),
                'compare' => 'EXISTS' // no hace nada, solo un recordatorio
            ),
            array(
                'key'     => self::get_key('keywords'),
                'compare' => 'EXISTS' // no hace nada, solo un recordatorio
            )
        ),
        'suppress_filters' => false,
    ));