Пагинация не работает с пользовательским циклом

У меня была похожая проблема сегодня...

У вас есть пользовательский тип записи (custom post type) и страница или запись с одинаковым ярлыком (slug)? То есть, есть ли у вас страница с URL /real-estate и пользовательский тип записи с переписанным URL также на /real-estate?

Если это так, у вас не может быть двух элементов с одинаковым URL, иначе WordPress запутается.

Вы можете либо изменить URL, либо попробовать это http://wordpress.org/support/topic/pagination-with-custom-post-type-listing?replies=23#post-1637753. Я выбрал изменение URL, но кто-то там написал пользовательский запрос, чтобы обойти проблему

Я использую это для кастомной пагинации, и это работает отлично

//пагинация для рассылки

     //определяем в файле функций
      function custom_pagination($numpages = '', $pagerange = '', $paged='')  {

      if (empty($pagerange)) {
        $pagerange = 2;
      }

      /**
       * Эта первая часть нашей функции является резервным вариантом
       * для кастомной пагинации внутри обычного цикла, который
       * использует глобальные переменные $paged и $wp_query.
       * 
       * Это хорошо, потому что теперь мы можем переопределить стандартную пагинацию
       * в нашей теме и использовать эту функцию как в стандартных запросах,
       * так и в кастомных.
       */

      if ($paged == '') {
          global $paged;
          if (empty($paged)) {
            $paged = 1;
          }
      }
      if ($numpages == '') {
        global $wp_query;
        $numpages = $wp_query->max_num_pages;
        if(!$numpages) {
            $numpages = 1;
        }
      }

      /** 
       * Формируем аргументы пагинации для передачи в функцию
       * paginate_links.
       */

      $pagination_args = array(
        'base'            => get_pagenum_link(1) . '%_%',
        'format'          => 'page/%#%',
        'total'           => $numpages,
        'current'         => $paged,
        'show_all'        => false,
        'end_size'        => 1,
        'mid_size'        => $pagerange,
        'prev_next'       => true,
        'prev_text'       => __('◄'), // стрелка влево
        'next_text'       => __('►'), // стрелка вправо
        'type'            => 'plain',
        'add_args'        => true,
        'add_fragment'    => '',
        'after_page_number' => '',
        'before_page_number' =>'',
        );
     $paginate_links = paginate_links($pagination_args);

      if ( $paginate_links ) {
        echo "<nav class='custom-pagination'>";
          //echo "<span class='page-numbers page-num'>Страница " . $paged . " из " . $numpages . "</span> ";
          echo $paginate_links;
        echo "</nav>";
      }
    }
    ?>

// Определяем это для любого шаблона, например template-newsletter

    <?php  $paged = ( get_query_var('paged') ) ? get_query_var('paged') : 1;
                               $newslatter_detail = array(
                               'post_type' => 'newsletter',
                               'post_status' => 'publish',
                               'posts_per_page' =>4,
                               'order' => 'ASC',
                               //'orderby' =>'date',
                               'paged' => $paged
                               );
                               $posts = new WP_Query( $newslatter_detail );
                               $posts_array = get_posts( $newslatter_detail );
                              if ( $posts -> have_posts() ) {
                               while ( $posts->have_posts() ) : $posts->the_post();
                               the_title();
                               endwhile;
                        wp_reset_postdata();
              } else { ?>
                 Ничего не найдено.
                <?php } ?>

              <div class="pagination">
                    <?php
                       if (function_exists(custom_pagination)) {
                        custom_pagination($posts->max_num_pages,"",$paged);
                       }
                       ?>
                 </div>

Это решение сработало для меня, с использованием части исходного кода от nurain и ответа Jan Fabry:

<?php
$paged = (get_query_var('paged')) ? get_query_var('paged') : 1;
$myquery = new WP_Query(
    array(
        'posts_per_page' => '2',
        'paged'=>$paged
        // можно добавить другие параметры в массив wp_query
    )   
);  
?>

<?php
if ($myquery->have_posts()) :  while ($myquery->have_posts()) : $myquery->the_post();
?>

<!-- Начало вывода поста. Пример ниже: -->

<div class="article-box">                               
<h2 class="article-title"><a href="<?php the_permalink(); ?>"><?php the_title(); ?></a></h2>
<p class="article-excerpt"><?php echo(get_the_excerpt()); ?></p>                        
</div>

<!-- Конец вывода поста -->

<?php endwhile; ?>
<?php wp_pagenavi( array( 'query' => $myquery ) ); ?><!-- ВАЖНО: убедитесь, что передаёте массив с ранее объявленными параметрами запроса -->
<?php wp_reset_query(); ?>
<?php else : ?>
<p>Посты не найдены</p>
<?php endif; ?>

Вы можете отобразить свой пользовательский тип записи, используя этот метод, и ваша пагинация будет работать!

<?php
  query_posts( array( 'post_type' => 'post', 'posts_per_page' => '2', 'paged' =>     get_query_var( 'paged' ) ) ); 

  if (have_posts() ) :  while (have_posts() ) : the_post(); 
?>
<!-- Начало вашей записи. Пример ниже: -->
<div class="article-box">                               
<h2 class="article-title"><a href="<?php the_permalink(); ?>"><?php the_title(); ?></a></h2>
<p class="article-excerpt"><?php echo(get_the_excerpt()); ?></p>                        
</div>
<!-- Конец вашей записи -->
<?php endwhile; ?>
<?php wp_pagenavi(); ?><!-- ВАЖНО: убедитесь, что здесь включен массив с ранее объявленными значениями запроса -->
<?php wp_reset_query(); ?>
<?php else : ?>
<p>Записи не найдены</p>
<?php endif; ?>