Запрос постов или получение постов по произвольным полям, возможно ли?

Для запроса записей по пользовательским полям можно использовать параметр 'meta_query'

<?php
$args = array(
    'post_type' => 'payment',
    'meta_query' => array(
            array(
                'key' => 'bookingref', // ключ метаполя
                'value' => 'the_value_you_want', // искомое значение
                'compare' => 'LIKE' // тип сравнения
            ),
            array(
                'key' => 'customerref', // ключ метаполя
                'value' => 'the_value_you_want', // искомое значение
                'compare' => 'LIKE' // тип сравнения
            )
    )
);
query_posts($args); while (have_posts()) : the_post();
?>

Нельзя использовать get_post_meta внутри запроса, так как эта функция возвращает значение, а не ключ, кроме того, она требует ID записи для получения значения, а до выполнения запроса $post->id не определен.