¿Cómo evitar el escape al guardar código HTML en un valor de opción?

Tomé otro enfoque para esto. Codifiqué y decodifiqué mis opciones con entidades HTML. Una cosa de la que no estoy seguro es si esto abre una fea puerta trasera para que la gente introduzca HTML comprometedor. Estoy confiando en el hecho de que solo los administradores editarán las opciones del tema de todos modos, pero tal vez estoy siendo ingenuo.

Así es como se ve cuando guardo una opción:

update_option('my_option', htmlentities(stripslashes($_REQUEST['my_option'])));

Y así es como se ve cuando recupero una opción:

html_entity_decode(get_option('my_option',htmlentities($my_default_value)));

Esto no es una respuesta completa a tu pregunta, pero posiblemente te oriente en la dirección correcta: Podrías probar <?php esc_textarea( $text ) ?>, como detalla el codex aquí: http://codex.wordpress.org/Function_Reference/esc_textarea.

Mis propios fragmentos de código para textareas en metaboxes se ven así:

<?php 
  if ( $meta_box['type'] == "textarea" ) {
    $meta_box_value = esc_textarea( get_post_meta($post->ID, $meta_box['name'].'_value', true) );
    echo '<textarea class="meta-textarea" style="width: 100%;" cols="20" rows="2" name="' . $meta_box['name'] . '_value">' . $meta_box_value . '</textarea><br />';
  }
?>