Los shortcodes no funcionan en tema personalizado

Estoy usando un tema personalizado que no desarrollé yo mismo que parece tener deshabilitada o no tiene la función para ningún shortcode, ya sean shortcodes de WordPress o shortcodes de plugins. Principalmente necesito que esta función funcione a través de shortcodes generados por plugins. He revisado varias cosas para ver qué lo está causando pero no he tenido suerte encontrando dónde está el problema. Esto es lo que he verificado.

Cuando cambié de vuelta al tema 2012, los shortcodes funcionaban bien.

He desactivado todos mis otros plugins para verificar si se debía a alguna incompatibilidad. Sin cambios.

Me he asegurado de que la plantilla de página tiene el loop correcto según esta publicación: los shortcodes de plugins no funcionan en tema personalizado - no sé cómo arreglarlo

*Edición: Aquí está el código de la plantilla de página

    <?php get_header(); ?>
<div id="main">
<div class="layout">

    <div id="content">
    <aside id="block_menu_like_division">
        <section>
            <h1 id="title_like_division"></h1>
            <nav id="nav_like_division">

            </nav>
        </section>
    </aside>
      <section>
        <article> 
          <?php // mientras ( have_posts() ) : the_post(); 
            if(get_the_content()){
          ?>

            <?php if(get_the_ID() == 1228) { ?>
                <h1>Formularios</h1>
                <?php the_content(); ?>
            <?php }elseif(get_the_ID() == 1191){ ?>
               <!-- <h5>&nbsp</h5> -->
                <?php the_content(); ?>
            <?php }else{ ?>

                <h1><?php the_title(); ?></h1>
        <?php
                    function sup($text){

                        $true = preg_replace('#(\d+)(st|th|nd|rd)#', '$1<sup class="super">$2</sup>', $text);
                        return $true;

                    }
                echo sup(get_the_content()); ?>
            <?php } ?>
            <?php }else{
                $arg = query_posts(array('post_parent' => get_the_ID(), 'post_type' => 'page', 'posts_per_page'=>1,  'orderby' => 'menu_order', 'order' => 'ASC' ));

//                    $arg[0]->guid;
                ?>
                <?php if($arg[0]->ID == 1811):?>
                <?php
                $ag = query_posts(array('post_parent' => $arg[0]->ID, 'post_type' => 'page','posts_per_page'=>1,  'orderby' => 'menu_order',  'order' => 'ASC' ));
                ?>
                <h1><?php echo $ag[0]->post_title; ?></h1>
                <?php echo $ag[0]->post_content; ?>
                <?php else:?>
                <h1><?php echo $arg[0]->post_title; ?></h1>
                <?php echo $arg[0]->post_content; ?>
                <?php endif;?>
                <?php }?>
          <?php // endwhile; // fin del loop. ?>
        </article>
      </section>
    </div>
    <aside>
        <?php include('quick_links.php'); ?>



        <?php
        $url = $_SERVER['REQUEST_URI'];
        $url_parse = parse_url($url);
        $level = explode('/', $url_parse['path']);


        if($level[1] == 'education' || $level[1] == 'fellowship'):?>
        <?php
        $catid = get_query_var('cat');
            $s = query_posts( array(
                'post_type' => 'post',
                'post_status' => 'publish',
                'category' => 'news',
                'posts_per_page' => 0, 
                'orderby' => 'post_date',
                'order' => 'DESC'));
        while( have_posts() ) : the_post();
            $newsList[] = array(
                'title' => get_the_title(),
                'link' => apply_filters('the_permalink', get_permalink()),
                'date' => apply_filters('the_time', get_the_time( 'F j, Y' ), 'F j, Y'),
                'expert' => apply_filters('the_excerpt', get_the_excerpt()),
                'author' => get_the_author(),
                );
        endwhile;
        wp_reset_query();


        ?>
        <section>
            <h2>Noticias e Información</h2>
                <div id="asideNews" class="itemsList">
            <div class="listItem">
                <article>
                    <header>
                        <h3><a href="<?php echo $newsList[0]['link']; ?>"><?php echo $newsList[0]['title']; ?></a></h3>
                    </header>
                    <p><?php echo $newsList[0]['expert']; ?></p>
                    <div class="readmore"><a href="<?php echo $newsList[0]['link']; ?>">Leer Más</a></div>
                </article>
            </div>
        </div>


            </section>

        <?php else:?>
        <?php

            include('testimonials.php');

            ?>
      <?php endif;?>

    </aside>
</div>

</div>
<?php get_footer(); ?>

Existe la posibilidad de que el desarrollador original simplemente reutilizó un tema desarrollado para una versión más antigua de WordPress cuando los shortcodes no existían.

¿Alguna idea de dónde buscar a continuación?