Agregar subtítulo al título del producto en Woocommerce

Para responder a tu primera pregunta, obtener tu post meta »bookauthor« de esta manera hará que se muestre/eco solo eso. Si estás definiendo la variable $id correctamente en tu código - o puedes hacerlo como se muestra a continuación.

El código debería responder a tu segunda pregunta, sobre cómo insertar tu segunda línea de título en la página del producto mediante el hook woocommerce_single_product_summary. Solo añade tu información extra así:

    function wpse116660_wc_add_2nd_title() {
        ?>
        <div class="2nd-tile">
            <?php echo get_post_meta(get_the_ID(), "bookauthor", true); ?>
        </div>
        <?php
    }
    add_action( 'woocommerce_single_product_summary', 'wpse116660_wc_add_2nd_title', 6 );

Para tener un poco más de comodidad con tus metadatos personalizados, puedes hacer lo que sugirieron @pl4g4 y @brasofilo y añadir un metabox a la pantalla de edición del producto, pero no es necesario por supuesto, parece que sabes cómo hacerlo con el metabox estándar de campos personalizados de WordPress.

Puedes añadir tu metabox así, el código está basado en el primer ejemplo de la página del codex de WordPress sobre add_meta_box.

/**
 * Añade un cuadro a la columna principal en las pantallas de edición de Entrada y Página.
 */
function wpse116660_wc_2nd_title_mb() {

    $screen = array( 'product' );

        add_meta_box(
            'wc_2nd_title_mb',
            __( '2nd title', 'your_textdomain' ),
            'wc_2nd_title_inner_mb',
            $screen,
            'advanced',
            'high'
        );
}
add_action( 'add_meta_boxes', 'wpse116660_wc_2nd_title_mb', 0 );

/**
 * Imprime el contenido del cuadro.
 * 
 * @param WP_Post $post El objeto para la entrada/página actual.
 */
function wpse116660_wc_2nd_title_inner_mb( $post ) {

  // Añade un campo nonce para que podamos verificarlo más tarde.
  wp_nonce_field( 'wc_2nd_title_inner_mb', 'wc_2nd_title_inner_mb_nonce' );

  /*
   * Usa get_post_meta() para recuperar un valor existente
   * de la base de datos y usa el valor para el formulario.
   */
  $value = get_post_meta( $post->ID, 'bookauthor', true );

  echo '<label for="bookauthor_field">';
       _e( "Autor del libro", 'your_textdomain' );
  echo '</label> ';
  echo '<input type="text" id="bookauthor_field" name="bookauthor_field" value="' . esc_attr( $value ) . '" size="50" />';

}

/**
 * Cuando se guarda la entrada, guarda nuestros datos personalizados.
 *
 * @param int $post_id El ID de la entrada que se está guardando.
 */
function wpse116660_wc_2nd_title_save_postdata( $post_id ) {

  /*
   * Necesitamos verificar que esto proviene de nuestra pantalla y con la autorización adecuada,
   * porque save_post puede activarse en otros momentos.
   */

  // Comprueba si nuestro nonce está establecido.
  if ( ! isset( $_POST['wc_2nd_title_inner_mb_nonce'] ) )
    return $post_id;

  $nonce = $_POST['wc_2nd_title_inner_mb_nonce'];

  // Verifica que el nonce es válido.
  if ( ! wp_verify_nonce( $nonce, 'wc_2nd_title_inner_mb' ) )
      return $post_id;

  // Si es un autoguardado, nuestro formulario no se ha enviado, así que no queremos hacer nada.
  if ( defined( 'DOING_AUTOSAVE' ) && DOING_AUTOSAVE ) 
      return $post_id;

  // Comprueba los permisos del usuario.
  if ( 'page' == $_POST['post_type'] ) {

    if ( ! current_user_can( 'edit_page', $post_id ) )
        return $post_id;

  } else {

    if ( ! current_user_can( 'edit_post', $post_id ) )
        return $post_id;
  }

  /* OK, es seguro para nosotros guardar los datos ahora. */

  // Sanitiza la entrada del usuario.
  $mydata = sanitize_text_field( $_POST['bookauthor_field'] );

  // Actualiza el campo meta en la base de datos.
  update_post_meta( $post_id, 'bookauthor', $mydata );
}
add_action( 'save_post', 'wpse116660_wc_2nd_title_save_postdata' );