Obtener valores de la cadena de consulta para rellenar campos ocultos en Ninja Forms

Parece que puedes usar la acción ninja_forms_display_init para llenar un campo.

Para obtener el ID del trabajo desde la URL que mencionaste arriba, puedes usar el arreglo $_GET.

Adaptando el código de esa página de documentación, algo como esto debería lograr lo que buscas:

function wpse_158000_populate_field($form_id) {
    global $ninja_forms_loading;

    $job_id_field = 3; //coloca aquí el ID de tu campo oculto

    //Cambia el valor con el que se prellena un campo.
    $ninja_forms_loading->update_field_value($job_id_field, $_GET['jid']);
}

add_action('ninja_forms_display_init', 'wpse_158000_populate_field');

Su documentación enumera varias otras acciones a las que puedes vincular.

Si prefieres usar URLs más limpias, podrías enlazarte a la acción rewrite_rules_array y así podrías tener una URL más como http://www.example.com/aplicar/2 donde 2 es el ID del trabajo al que están aplicando y "aplicar" es el slug de tu página de solicitud.

También podrías llevar esto más allá y usar el slug del trabajo en lugar del ID para una URL más amigable, luego obtener el ID de ese trabajo a través del slug y añadir ese ID al valor de tu campo oculto.