URLs relativas y ocultar /wp-content/themes/ en WordPress

La forma más fácil de mover tu carpeta de temas es solo mediante constantes; incluye la carpeta wp-content. Puedes definir una constante para la carpeta de plugins y la carpeta wp-content. Así tus plugins y temas estarán en URLs separadas, también en el código fuente del frontend.

Como este ejemplo para mis instalaciones de desarrollo:

define( 'WP_CONTENT_DIR',  dirname( __FILE__ ) . '/wp-content' );
define( 'WP_CONTENT_URL',  'http://' . $_SERVER['HTTP_HOST'] . '/wp-content' );
// Directorio personalizado para plugins
define( 'WP_PLUGIN_DIR',   dirname( __FILE__ ) . '/wp-plugins' );
define( 'WP_PLUGIN_URL',   'http://' . $_SERVER['HTTP_HOST'] . '/wp-plugins' );
// Directorio personalizado para mu-plugins 
define( 'WPMU_PLUGIN_DIR', dirname( __FILE__ ) . '/wpmu-plugins' );
define( 'WPMU_PLUGIN_URL', 'http://' . $_SERVER['HTTP_HOST'] . '/wpmu-plugins' );

Actualmente utilizo la técnica que describo en esta pregunta: Pasos para ocultar que un sitio utiliza WordPress.

Anteriormente, usaba el método del Tema Roots, que es lo que creo que estás buscando:

Esta publicación contiene información sobre cómo limpiar la salida del código de WordPress. Los métodos descritos a continuación no evitan la identificación real y no deben considerarse como una medida de seguridad.

Ten en cuenta que no funciona en Multisitio ni en Temas Hijos.

Reproduciré aquí la documentación que hice para usar el método Roots:

Modificando las reglas de reescritura en .htaccess

Gran parte del código proviene directamente del tema Roots:
https://gist.github.com/4336843 ^{Espejo en PasteBin}.
El array $roots_new_non_wp_rules debe adaptarse según corresponda.

Actualizar los enlaces permanentes

Ve a /wp-admin/options-permalink.php y haz clic en Guardar cambios.

Cargar scripts desde CDN y no desde /wp-includes/

add_action( 'wp_enqueue_scripts', 'wpse_76593_scripts_custom' );

function wpse_76593_scripts_custom() {
        wp_deregister_script('jquery');
        wp_register_script('jquery', 'https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.7.1/jquery.min.js', false, '1.7.1', true);
        wp_enqueue_script( 'jquery' );
}

Busca en el tema todos los registros y colas de estilos y scripts.

style.css

1. Crea un nuevo archivo dentro de la carpeta "/css" llamado "style.css"
2. Abre el style.css del tema
3. Selecciona todas las declaraciones debajo de la cabecera del archivo del tema
4. Córtalas y pégalas en el archivo /css/style.css

5. Guarda ambos

   En resumen: /your-theme/styles.css contendrá solo la información de la cabecera, y /your-theme/css/styles.css contendrá todos los estilos

   • Cambia todas las ocurrencias de url('fonts/ por url('../fonts/
   • Cambia todas las ocurrencias de images/ por ../images/

header.php

Cambia el enlace de la hoja de estilos de:

<link rel="stylesheet" type="text/css" media="all" href="<?php bloginfo( 'stylesheet_url' ); ?>" />

a:

<link rel="stylesheet" type="text/css" media="all" href="<?php echo get_template_directory_uri(); ?>/css/style.css" />

Todos los archivos del tema

Busca:

• get_bloginfo('template_url')
• get_bloginfo('template_directory')

y reemplaza con:

• get_template_directory_uri()

Pruebas

No estoy seguro de otros navegadores, pero la Ventana de Actividad de Safari es perfecta para verificar todos los archivos cargados y sus URLs.

Dependiendo de la complejidad del tema, pueden ser necesarios pasos adicionales.

Creé el Roots Plug que tiene las mismas reglas de reescritura en el .htaccess que el Tema Roots. Pero estoy completamente de acuerdo con lo que @brasofolio dijo

Esto se puede lograr fácilmente usando el plugin 'hide my wp'. Por favor, cambia sus ajustes de enlaces permanentes y URLs como se muestra a continuación:

Cambia la ruta del tema en Permalinks & urls a /incs.

Una vez que hayas cambiado estos ajustes, notarás que bloginfo('template_url') mostrará http://website.com/incs/ y por lo tanto

 http://website.com/incs/js/script.js

Referencia: http://howtomakewebsite.ws/wordpress-plugins/how-to-hide-wordpress/731/

¿Por qué no usas bloginfo(); las funciones por defecto de WordPress?

<?php bloginfo( $show ); ?> 

<script src="<?php bloginfo('template_directory'); ?>/incs/js/script.js"></script>

más información http://codex.wordpress.org/Function_Reference/bloginfo