Regole di Rewrite WordPress per Custom Post Type e Tassonomia

Spero che questo possa risolvere il tuo problema

function my_custom_post_type() {
$labels = array(
    'name' => _x('Progetti', 'post type general name'), // Nome generale del tipo di post
    'singular_name' => _x('Progetto', 'post type singular name'), // Nome singolare del tipo di post
    'add_new' => _x('Aggiungi nuovo', 'project item'), // Testo per aggiungere nuovo elemento
    'add_new_item' => __('Aggiungi nuovo progetto'), // Testo per aggiungere nuovo progetto
    'edit_item' => __('Modifica progetto'), // Testo per modificare progetto
    'new_item' => __('Nuovo progetto'), // Testo per nuovo progetto
    'view_item' => __('Visualizza progetto'), // Testo per visualizzare progetto
    'search_items' => __('Cerca progetti'), // Testo per cercare progetti
    'not_found' =>  __('Nessun risultato trovato'), // Messaggio se non trovato
    'not_found_in_trash' => __('Nessun risultato trovato nel cestino'), // Messaggio se non trovato nel cestino
    'parent_item_colon' => '',
    'menu_name' => 'Progetti' // Nome nel menu
);

$args = array(
    'labels' => $labels,
    'public' => true,
    'publicly_queryable' => true,
        'hierarchical' => false,
        'has_archive' => true,
    'rewrite' => array('slug'=>'lavoro', 'with_front'=>false), // Slug personalizzato
    'show_ui' => true,
    '_builtin' => false, // È un tipo di post personalizzato, non integrato!
    'capability_type' => 'post',
        'query_var' => true, // Questo va nello schema WP_Query
    'menu_position' => null,
    'supports' => array('title','editor','thumbnail', 'comments', 'author', 'excerpt') // Funzionalità supportate
);

register_post_type( 'lavoro' , $args ); // Registra il tipo di post personalizzato

}
function my_custom_taxonomies() {

    $labels = array(
        'name' => __( 'Tassonomia', 'taxonomy general name' ), // Nome generale della tassonomia
        'singular_name' => __( 'Tassonomia', 'taxonomy singular name' ), // Nome singolare della tassonomia
        'search_items' =>  __( 'Cerca tassonomia' ), // Testo per cercare tassonomia
        'all_items' => __( 'Tutte le tassonomie' ), // Testo per tutte le tassonomie
        'parent_item' => __( 'Tassonomia genitore' ), // Testo per tassonomia genitore
        'parent_item_colon' => __( 'Tassonomia genitore:' ), // Testo per tassonomia genitore con due punti
        'edit_item' => __( 'Modifica tassonomia' ), // Testo per modificare tassonomia
        'update_item' => __( 'Aggiorna tassonomia' ), // Testo per aggiornare tassonomia
        'add_new_item' => __( 'Aggiungi nuova tassonomia' ), // Testo per aggiungere nuova tassonomia
        'new_item_name' => __( 'Nome nuova tassonomia' ), // Testo per nome nuova tassonomia
        'menu_name' => __( 'Tassonomia' ), // Nome nel menu
    );  

    register_taxonomy( 'tassonomia', array('lavoro'), array ( // Registra la tassonomia personalizzata
                    'labels' => $labels,
                    'hierarchical' =>false,
                    'show_ui' => true,
                    'rewrite' => array( 'slug' => 'lavoro/tassonomia'), // Slug personalizzato
                    'query_var' => true,
                    'show_in_nav_menus' => true,
                    'public' => true,
            ));
}

add_action('init', 'my_custom_post_type', 0); // Hook per registrare il tipo di post
add_action('init', 'my_custom_taxonomies', 10); // Hook per registrare la tassonomia

ciò che devi creare è archive-lavoro.php (l'archivio del tuo tipo di post) e taxonomy.php che verrà utilizzato per mostrare l'archivio della tua tassonomia personalizzata.

Ho avuto lo stesso problema e dopo molte difficoltà sono arrivato a questa soluzione.
Basta aggiungere questo al tuo codice

global $wp_rewrite;
$wp_rewrite->flush_rules(); 

function my_custom_post_type() {
    $labels = array(
        'name' => _x('Progetti', 'post type general name'),
        'singular_name' => _x('Progetto', 'post type singular name'),
        'add_new' => _x('Aggiungi nuovo', 'voce progetto'),
        'add_new_item' => __('Aggiungi nuovo progetto'),
        'edit_item' => __('Modifica progetto'),
        'new_item' => __('Nuovo progetto'),
        'view_item' => __('Visualizza progetto'),
        'search_items' => __('Cerca progetti'),
        'not_found' =>  __('Nessun risultato trovato'),
        'not_found_in_trash' => __('Nessun risultato trovato nel cestino'),
        'parent_item_colon' => '',
        'menu_name' => 'Progetti' 
    );

    $args = array(
        'labels' => $labels,
        'public' => true,
        'publicly_queryable' => true,
            'hierarchical' => false,
            'has_archive' => true,
        'rewrite' => array('slug'=>'work', 'with_front'=>false),
        'show_ui' => true,
        '_builtin' => false, // È un custom post type, non built-in!
        'capability_type' => 'post',
            'query_var' => true, // Questo va nello schema WP_Query
        'menu_position' => null,
        'supports' => array('title','editor','thumbnail', 'comments', 'author', 'excerpt')
    );

    register_post_type( 'work' , $args );

    global $wp_rewrite;   
    $wp_rewrite->flush_rules();    // questo dovrebbe aiutare 
}

Una spiegazione più dettagliata è disponibile in un altro articolo, ma ecco le parti fondamentali che devi aggiungere:

1. Registra le tue tassonomie e custom post type come fai di solito. Assicurati che lo slug di rewrite per la tassonomia sia "basename" e lo slug di rewrite per il CPT sia "basename/%tax_name%".

2. Indica a WordPress cosa fare con "%tax_name%" in questo modo:

   function filter_post_type_link($link, $post)
   {
   if ($post->post_type != 'custom_post_type_name')
       return $link;
   
   if ($cats = get_the_terms($post->ID, 'taxonomy_name'))
   {
       // Sostituisce il segnaposto %taxonomy_name% con l'ID del termine
       $link = str_replace('%taxonomy_name%',array_pop($cats)->term_id, $link); // vedi la funzione personalizzata definita sotto
   }
   return $link;
   }
   add_filter('post_type_link', 'filter_post_type_link', 10, 2);