Rimuovere lo slug del custom post type dall'URL

Ecco come puoi fare la prima parte del lavoro - rimuovere lo slug del CPT dal link dell'articolo (ad esempio per il post type news).

function df_custom_post_type_link( $post_link, $id = 0 ) {  

    $post = get_post($id);  

    if ( is_wp_error($post) || 'news' != $post->post_type || empty($post->post_name) )  
        return $post_link;  

    return home_url(user_trailingslashit( "$post->post_name" ));  
}
add_filter( 'post_type_link', 'df_custom_post_type_link' , 10, 2 );

Ora dovrai aggiungere le regole di riscrittura per 'news', altrimenti otterrai un errore 404.

Aggiungi la regola di riscrittura in questo modo:

function df_custom_rewrite_rule() {
    add_rewrite_rule('(.*?)$', 'index.php?news=$matches[1]', 'top');
}
add_action('init', 'df_custom_rewrite_rule');

Infine dovrai svuotare le regole di riscrittura, quindi vai su Impostazioni - Permalink e salva le modifiche.

Puoi provare questo plugin (http://wordpress.org/extend/plugins/remove-slug-from-custom-post-type/) per rimuovere lo slug, ma funzionerà solo se la struttura dei permalink è impostata su "/%postname%/".

function register_cpt_type() {
    register_post_type('cpt', array(
        'rewrite' => array("slug" => "/cpt", "with_front" => false),
    ));
}
add_action('init', 'register_cpt_type')

function cpt_rewrite_rule() {
    add_rewrite_rule('(.*?)$', 'index.php?cpt=$matches[1]', 'top');
}
add_action('after_theme_setup', 'cpt_rewrite_rule');

svuota/ricicla le riscritture URL, poi modifica .htaccess

RewriteRule ^cpt/(.+)$ /$1 [R=301,L]

Puoi sempre agganciarti a "parse_request" per eseguire un controllo e verificare se esiste un tipo personalizzato con il nome richiesto e quindi modificare i query_vars in modo appropriato. Avrai bisogno di qualcosa simile alla risposta di @Bartosz per generare anche il permalink:

 add_filter('parse_request', "t21_parse_request" , 1, 1);

 function t21_parse_request($wpobj)
 {
      $query_vars = $wpobj->query_vars;
      $slug = $query_vars['pagename'];

      $posts = get_posts(array(
           "post_type" => "event",
           "post_name" => $slug
      ));

      if($posts)
      {
           //sappiamo che la tua voce "event" esiste, quindi ora modifichiamo i query_vars
           //prima rimuoviamo 'page' e 'pagename'
           unset($query_vars['page']);
           unset($query_vars['pagename']);

           //ora ricostruiamo i query_vars
           $query_vars['post_type'] = "event"; //nome del CPT
           $query_vars['name'] = $slug;
           $query_vars['event'] = $slug; //di nuovo - questo costruisce la stringa di query "event=myevent"
      }
      else
      {
           //restituiamo semplicemente $wpobj poiché sappiamo che non c'è nessun "event"
           return $wpobj;
      }
 }

Tuttavia, questo presuppone che non avrai nessun nome di post con lo stesso nome di un postname, altrimenti il post non apparirà mai poiché corrisponde prima a un tipo di evento.